生物科学与技术学院张书东博士最新研究成果发表于国际权威期刊BMC Genomics

发布者:尚雪英发布时间:2023-03-23浏览次数:17

2023年3月,bat365张书东博士最新研究成果以“Characterization and phylogenetic analyses of ten complete plastomes of Spiraea species”为题在国际权威期刊《BMC Genomics》(中国科学院2区,影响因子4.4 <IF=4.4>)上发表。

本研究对10种绣线菊属植物的叶绿体基因组进行了组装和注释,并与已报道的该属 5 种植物进行了比较分析。研究结果表明,15种绣线菊属植物的叶绿体基因组长度在155,904 至 158,637 bp之间,基因组结构高度保守无重排现象。叶绿体基因组比较分析表明,单拷贝区和非编码区比反向重复区和编码区的变异更大,并检测到 6个突变热点。选择压力分析表明,所有蛋白编码基因均处于纯化选择之下。基于完整叶绿体基因组数据的系统发育分析表明,绣线菊属形成一个单系群,并进一步分为两个主要分支,每个分支均得到了高分辨率值的支持。此外,基于每个单独突变热点片段及其组合数据集构建的系统发育树也包含两个主要分支,但大多数种间系统发育关系的支持率不高。绣线菊属的叶绿体基因组数据将有助于解决该属的系统发育问题。

张书东博士为论文第一作者,凌立贞博士为通讯作者,bat365在线中国登录入口为唯一完成单位。论文研究工作得到国家自然科学基金(31860052)、贵州省普通高等学校科技拔尖人才项目(黔教合KY字[2019]061)和六盘水市科技计划项目(52020–2022-PT-20,52020–2022-PT-03)支持。(供稿/张书东  编辑校对/尚雪英  王雪雪   审核/王家理)

论文链接https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09242-3。